PYM0FM-fMRI数据分析

模块供应商: Psychology
学分数： 10 [5 ECTS credits]
水平:7
教学用语： 秋天 term module
先决条件:
模块化的必备条件:
相关内容:
模块被排除在外:
目前从: 2021/2

模块召集人: Etienne Roesch博士
电子邮件: e.b.roesch@reading.ac.uk

模块类型：

概述模块描述：

本模块的目的是为学生提供认知神经科学领域关于大脑的工作知识，以及分析功能磁共振成像数据的实践经验。 该模块结合了使用大学云计算基础设施的讲座和数据处理的实践经验。 学生将熟悉典型处理管道的每一步，学习如何编写脚本和自动化分析，并介绍可重复神经成像的最佳实践。  注册本模块的学生应该对本科水平的统计有信心和能力，并拥有一般的计算技能（更多信息见大纲内容）。

目的:

介绍认知神经科学领域关于大脑的最新思想、技术和知识现状，并在功能磁共振成像数据分析中使用的工具和方法方面发展实用的专业知识。 学生将培养对神经影像学的批判性欣赏，以理解当前的方向和方法辩论，并支持该领域的职业发展。

可评估的学习成果：

在课程结束时，学生应该能够：

1. 使用常见的神经解剖学术语来描述大脑


2. 了解脑功能的主要机制，包括神经元的电特性、神经递质和血氧水平依赖信号的血管耦合机制


3. understand theoretical issues in fMRI data analysis (e.g., haemodynamic response, motion and other art efacts in the time series, the multiple statistical comparisons problem)


4. 理解并执行fMRI时间序列的预处理（例如，重新排列，配准到标准空间，空间平滑）


5. 建立一个一般的线性模型，捕捉数据中的实验和干扰效应，并尝试一种或多种方法将模型拟合到数据中


6. 理解和导航报告激活的坐标系统（立体空间）


7. mak e statistical comparison of activation level across the brain between two experimental conditions (contrasts, t-test) for a single subject


8. 在组水平上比较两种实验条件下的激活。

额外的结果:

本模块将为脑成像NBA投注[手机]俱乐部研究中的分析方法提供有价值的介绍。 因此，它将为那些希望在nba投注学习中进行脑成像实验或在脑成像实验室寻求NBA投注[手机]俱乐部研究型职位的学生提供合适的基础。

大纲内容:

本模块涵盖了脑功能的主要机制和当前的争论，在理论和实践层面分析FMRI数据。 涵盖的主题包括神经解剖学、认知神经科学、MRI物理、FMRI实际测量的内容、FMRI数据的预处理以及FMRI数据的建模。

PYM0FM “fMRI Analysis” is designed to provide students with working knowledge of the statistical analysis of fMRI data, for students who are likely to want to analyse such complex dataset in future. We strongly advise you to only select this module if you are confident and competent with Undergraduate level statistics, and possess general computing skills: specifically, the module reviews the steps required to process and analyse fMRI-BOLD data, the theory and application of  inferential statistics (i.e. GLM, t-tests) and the scripting of reproducible analytical pipelines. If you are unsure, please carefully review the module descripti on and/or contact the Module Convenor for guidance.

教学方法简述：

关于大脑的理论内容和神经成像数据的统计分析在每节课开始时都有一个讲座。 在每个会话的第二部分，学生学习使用主要工具来分析功能磁共振成像数据。 示例数据集和期末作业与典型的大脑功能有关。

联系时间:

	秋天	春天	夏天
研讨会	40
引导自主学习：	60
按学期划分的总学时	100	0	0
模块总学时	100

总结性考核方法：

方法	百分比
报告	100

总结性评核-考试：

总结性评估-课程作业和课堂测试：

学生将获得一组数据，供他们独立分析和报告。 报告的分析应包括某些处理阶段的系统变化（例如空间平滑程度，或比较不同的模型拟合方法），以及相关方法学文献的一些报告。

形成性评价方法：
学生将能够通过该模块的实际组成部分提高他们的表现。

逾期提交的处罚：

下列资料适用于修读nba投注式课程的学生，但修读nba投注弹性课程的学生除外。 Penalties for late submission, and the associated procedures, which apply to Postgraduate Flexible programmes are specified in the policy 􀀓Penalties for late submission for Postgraduate Flexible programmes􀀔, which can be found here: /web/files/qualitysupport/penaltiesforlatesubmissionPGflexible.pdf
The Support Centres will apply the following penalties for work submitted late:

• 在原定截止日期（或任何正式同意的延期截止日期）之后提交的作业：截止日期后的每个工作日（或其中的一部分）将从该作业的总分数中扣除10%的分数，最多可达五个工作日；
• 如果作品在原始截止日期（或任何正式同意的截止日期延长）后超过五个工作日提交：将记录零分。

The University policy statement on penalties for late submission can be found at: /web/FILES/qualitysupport/penaltiesforlatesubmission.pdf
You are strongly advised to ensure that coursework is submitted by the relevant deadline. 您应该注意，建议在未完成状态下提交作业，而不是没有提交任何作业。

通过考试的评估要求：
50%

重新安排:

如果学生未能完成作业，可以提交一份替代的同等作业。  提交的任务和日期将由模块召集人和/或项目总监安排。 然而，学生们应该注意到，鉴于大学对不及格学分的规定，重新提交课程作业可能不符合他们的利益。

额外费用（适用时指定）：

1) Required text books: None

2) Specialist equipment or materials: None

3) Specialist clothing, footwear or headgear: None

4) Printing and binding: None

5) Computers and devices with a particular specification: None

6) Travel, accommodation and subsistence: None

最后更新: 7月5日